14 z nich będzie rozpoczynać lub kończyć bieg na tej stacji:
- TLK 13110/31110 Wit Stwosz relacji Warszawa Gdańska – Kraków Główny – Warszawa Gdańska (w stronę Warszawy od 26 marca);
- IC 17100/71101 Zamenhof relacji Warszawa Gdańska – Zielona Góra – Warszawa Gdańska (w stronę Zielonej Góry od 14 marca, z Zielonej Góry od 26 marca);
- IC 81112/18112 Noteć relacji Piła – Warszawa Gdańska – Piła;
- IC 15106/51106 Brda relacji Warszawa Gdańska – Bydgoszcz Główna – Warszawa Gdańska;
- IC 4120/4150 Daszyński relacji Bielsko-Biała/Zwardoń – Warszawa Gdańska (od 26 marca);
- IC 15100 Słowiniec relacji Warszawa Gdańska – Gdynia Główna;
- IC 1906 Rubinstein relacji Warszawa Gdańska – Łódź Fabryczna (od poniedziałku do piątku);
- IC 9109 Łęcka relacji Łódź Fabryczna – Warszawa Gdańska;
- IC 9111 Tuwim relacji Łódź Fabryczna – Warszawa Gdańska;
- IC 71104 Warta relacji Poznań Główny – Warszawa Gdańska (od 26 marca).
17 kolejnych będzie kursować przez stację Warszawa Gdańska oraz dodatkowo Warszawę Wschodnią:
- IC 91101/19100 Łodzianinrelacji Łódź Fabryczna – Warszawa Wschodnia – Łódź Fabryczna (w stronę Łodzi od 14 marca, z Łodzi od 26 marca);
- TLK 91131/19130 Zosia relacji Łódź Fabryczna – Warszawa Gdańska i Warszawa Wschodnia – Łódź Fabryczna (z Łodzi od poniedziałku do piątku, a z Warszawy oprócz sobót i niedziel w okresie 10-25 kwietnia i 8-30 maja);
- IC 1900/9101 Borynarelacji Warszawa Wschodnia – Łódź Fabryczna – Warszawa Wschodnia (w stronę Łodzi od 14 marca, z Łodzi od 26 marca);
- IC 1902/9103 Telimena relacji Warszawa Wschodnia – Łódź Fabryczna – Łódź Fabryczna;
- IC 1906/9107 Rubinstein relacji Warszawa Wschodnia – Łódź Fabryczna – Warszawa Wschodnia (z Warszawy w soboty i niedziele);
- IC 1910 Tuwim relacji Warszawa Wschodnia – Łódź Fabryczna;
- IC 1912 Syrenarelacji Warszawa Wschodnia – Łódź Fabryczna;
- IC 41105/14104 Kmicic relacji Częstochowa – Warszawa Wschodnia – Częstochowa (w stronę Warszawy od 26 marca);
- IC 1420/1450 Daszyński relacji Warszawa Wschodnia – Bielsko-Biała/Zwardoń;
- IC 5130 Kujawiak relacji Bydgoszcz Główna – Warszawa Wschodnia (od 26 marca);
- IC 41010 Chopin relacji Bohumin – Warszawa Wschodnia (od 26 marca).
Dla kolejnych 9 pociągów tranzytujących Warszawę, stacja Warszawa Gdańska będzie jedynym postojem w stolicy:
- IC 6127/1626 Słowacki relacji Wrocław – Białystok – Wrocław;
- IC 72101 Lubuszanin relacji Zielona Góra – Chełm;
- TLK 18153 Parsęta relacji Łódź Fabryczna – Kołobrzeg;
- TLK 81114 Pobrzeżerelacji Kołobrzeg – Łódź Fabryczna (od 29 kwietnia);
- IC 5320 Żeromski relacji Olsztyn – Kraków Główny;
- IC 5422 Skarbek relacji Olsztyn – Bielsko-Biała;
- IC 1632 Dąbrowska relacji Białystok – Wrocław;
- IC 4122 Pilecki relacji Racibórz – Białystok.
Stacja Warszawa Wschodnia będzie jedynym postojem w Warszawie dla kolejnych 17 pociągów przewoźnika, z których niemal wszystkie będą na tej stacji zaczynać lub kończyć trasę:
- IC 31106/13106 San relacji Przemyśl – Warszawa Wschodnia – Przemyśl;
- IC 31104 Witos relacji Przemyśl – Warszawa Wschodnia;
- TLK 83170 Ustronie relacji Kołobrzeg – Kraków;
- IC 5128 Rejewski relacji Bydgoszcz – Warszawa Wschodnia;
- TLK 21110/12110 Nida relacji Kielce – Warszawa Wschodnia – Kielce;
- IC 11000/11010 Skaryna relacji Warszawa Wschodnia – Brześć – Warszawa Wschodnia;
- IC 11106/11110 Starzyński relacji Warszawa Wschodnia – Terespol – Warszawa Wschodnia;
- IC 11014/11004 Niemcewicz relacji Terespol – Warszawa Wschodnia – Terespol;
- TLK 21100 Chełmianin relacji Chełm – Warszawa Wschodnia;
- IC 2150 Oleńka relacji Lublin – Warszawa Wschodnia (w soboty oraz 4 kwietnia);
- TLK 21010 Kiev Expressrelacji Jagodin – Warszawa Wschodnia;
- IC 11012 Mickiewicz relacji Brześć – Warszawa Wschodnia.
5 pociągów obsługiwanych elektrycznymi zespołami trakcyjnymi (EZT) będzie kursować przez podmiejską linię średnicową z zatrzymaniem na stacji Warszawa Śródmieście (w zamian za pomijany postój Warszawa Centralna):
- IC 6123 Baczyński relacji Wrocław Główny – Warszawa Wschodnia (od 10 kwietnia do 30 maja w soboty i niedziele, oprócz 1 i 2 maja);
- IC 6121 Asnyk relacji Wrocław Główny – Warszawa Wschodnia (od 10 kwietnia do 30 maja w niedziele, oprócz 2 maja oraz 15 maja);
- IC 5322 Sienkiewicz relacji Olsztyn Główny – Kraków Główny;
- IC 12103 Czartoryski relacji Warszawa Zachodnia – Lublin Główny;
- IC 21104 Bystrzyca relacji Lublin Główny – Warszawa Zachodnia.
Ograniczona przepustowość linii kolejowych w Warszawie sprawia, że od 14 marca zawieszone zostanie kursowanie pociągów:
- EIC Krakus relacji Kraków – Warszawa – Kraków;
- EIC Norwid relacji Kraków – Warszawa – Kraków;
- TLK Krasiński relacji Warszawa – Wrocław – Warszawa;
- IC Modrzejewska relacji Kraków – Warszawa – Kraków;
- IC Lajkonik relacji Kraków – Gdynia – Kraków;
- EIC Ondraszek relacji Bielsko-Biała – Warszawa – Bielsko-Biała;
- EIC Klimczokrelacji Bielsko-Biała – Gdynia – Bielsko-Biała;
- EIC Ślęża relacji Warszawa – Wrocław – Warszawa.
PKP Intercity uruchomiło specjalną podstronę, gdzie zamieszczane są informacje o zmianach w rozkładzie jazdy, honorowaniu biletów i poruszaniu się w obrębie dworców w związku z pracami na Warszawskim Węźle Kolejowym.
